研究进展

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2022年7月,张犇课题组硕士研究生郭悦作为第一作者,在Plant Growth Regulation期刊在线发表论文“Comparative transcriptomics reveals key genes contributing to the differences in drought tolerance among three cultivars of Foxtail millet (Setaria italica)”。

谷子是旱作农业的主要粮食作物之一,其对干旱胁迫的反应是一个复杂的调控网络,不断发掘谷子抗旱候选基因,揭示谷子耐旱的分子调控机制和代谢途径,对农业生产具有重要的指导意义。在我们的前期研究中,我们检测了干旱胁迫下晋谷21和陇谷16中52个SNARE基因的转录水平,发现一些干旱诱导基因的转录调控在不同谷子品种间存在差异。因此,本研究进一步扩大了比较转录组的范围,比较了3个谷子品种(冀谷39、晋谷21和陇谷16)的抗旱性。结果表明,它们具有不同的耐旱性,冀谷39抗旱性最强,其次是晋谷21和陇谷16。然后,我们以这三个品种为材料,开展停水干旱胁迫下的转录组分析,获得了与抗旱性相关的差异表达基因。并且通过基因聚类和相关代谢途径分析,从生理、生化和转录组水平系统阐述了谷子响应干旱的机制。此外,我们确定了46个潜在干旱胁迫相关基因,其转录水平在胁迫下变化趋势与三个谷子品种的抗旱趋势一致。其中,32个基因是首次在谷子中发现的与干旱反应相关的基因,值得进一步研究。本研究为进一步探索谷子抗旱机理提供了有用的信息和理论依据。本工作得到了国家自然科学基金项目、山西省国家留学基金委项目、山西农业大学可持续旱地农业国家重点实验室开放资助项目、国家重点研发等项目的资助。

文章信息:

Guo, Y., Hao, D., Wang, X. et al. Comparative transcriptomics reveals key genes contributing to the differences in drought tolerance among three cultivars of foxtail millet (Setaria italica). Plant Growth Regul (2022). https://doi.org/10.1007/s10725-022-00875-0


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