研究进展

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2021年9月,张犇课题组硕士研究生王慧作为第一作者,在Plant Growth Regulation在线发表论文“Genome-wide identifcation and expression analysis of the SNARE genes in Foxtail millet (Setaria italica) reveals its roles in drought stress”。

SNARE家族膜转运蛋白通过介导膜融合作用及影响离子通道功能,在植物生长发育特别是胁迫响应过程中发挥重要作用。谷子是山西省特色耐旱作物,在汾酒酿造过程中是重要的原料之一。谷子基因组测序已经完成,但尚缺乏对SNARE家族基因的系统分析。在前期工作中,我们发现了不同株系谷子对干旱胁迫响应不同,如晋谷21苗期抗旱性强于陇谷16。本研究基于水稻及拟南芥SNARE基因数据,筛选鉴定谷子SNARE家族基因,发现谷子中共存在52个SNARE基因,分别为15 个Qa-SiSNARE, 11个Qb-SiSNARE, 9个Qc-SiSNARE, 3个Qb+c-SiSNARE以及15 个R-SiSNARE。从抗性不同谷子株系出发,分析SNARE基因在不同谷子株系中对干旱胁迫的响应情况,我们发现SiNPSN12, SiSEC20a, SiYKT11, SiSYP131, SiUSE11与 SiVAMP725水平仅在晋谷21中受到干旱胁迫上调,可能与抗旱优势性状相关,值得进一步探索。本研究受到国家自然科学基金青年基金,山西大学杏花村学院(山西酿造产业研究院(筹))开放课题项目,国家重点研发计划“杂粮产业链一体化示范”等项目支持。


文章信息:

Hui Wang. Dongdong Hao, Xiaoxia Wang, Haiying Zhang, Pu Yang, Lizhen Zhang, Ben Zhang (2021) Genome-wide identifcation and expression analysis of the SNARE genes in Foxtail millet (Setaria italica) reveals its roles in drought stress. Plant Growth Regulation. https://doi.org/10.1007/s10725-021-00746-0


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